Nel 19° secolo, in Inghilterra e in Scozia, dei cristiani convinti si riunivano regolarmente. Basandosi sulla Bibbia e sulla preghiera e sostenuti da profezie e guarigioni di ammalati, invocavano un risveglio dei doni dello Spirito Santo. Da qui sorse la comunità Cattolico-Apostolica. Dal 1832 essa era diretta da apostoli, vocati e chiamati da profeti. A causa di divergenze d'opinioni riguardanti singole interpretazioni della Sacra Scrittura e la vocazione di nuovi apostoli, nel 1863 fu fondata la "Missione universale cristiana e apostolica", dalla quale nacque poi la Chiesa Neo-Apostolica odierna.

Nell'anno 1893 un cristiano neo-apostolico proveniente dalla Germania del nord venne in Svizzera in cerca di un lavoro, che trovò a Zurigo. Si unì presto ad alcuni giovani uomini, i quali avevano un cuore aperto per la sua testimonianza di fede  e con essi edificò la prima comunità neo-apostolica in Svizzera. A Pentecoste 1895, con la fondazione della comunità di Zurigo-Hottingen, poté essere posato il basamento della Chiesa Neo-Apostolica Svizzera, che nel 1905 divenne un'area di lavoro indipendente quale distretto Svizzera-Baden.

La comunità crebbe e la fede neo-apostolica si diffuse nella città di Zurigo e poi anche in altre città svizzere. Dapprima nacquero le comunità di San Gallo, Basilea e Zofingen, più tardi ne sorsero a Winterthur, Sciaffusa e Berna ed in altri luoghi della Svizzera. La Chiesa Neo-Apostolica poté prender piede praticamente in ogni parte del Paese, segnando un costante sviluppo. Nell'anno 1940 si contavano in Svizzera già oltre 20'000 membri in 191 comunità. Dal 1970 il numero dei membri in Svizzera rimane costante a circa 35'000.